La thérapie du Dr John Pierrakos repose sur trois principes de base :
- L'être humain est une entité psychosomatique ;
- La guérison vient du dedans et non de l'extérieur : C'est donc en lui-même que le patient doit trouver la force et le désir de se guérir ;
- Toute existence constitue une unité qui se dirige à plus ou moins long terme vers l'évolution.